Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE22Q8NFJ8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE22Q8NFJ8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms