Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NUP35Q8NFH5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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