Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms