Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LINC00612Q8N6U2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms