Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLF2Q8IX21 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms