Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGDCC3Q8IVU1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms