Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P3H3Q8IVL6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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