Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME9Q86XW9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms