Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PBRM1Q86U86 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBRM1Q86U86 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms