Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMC4Q7Z404 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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