Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT27Q7Z3Y8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms