Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP9Q7RTR0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms