Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms