Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP47Q6ZTR5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP47Q6ZTR5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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