Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms