Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4L3Q6VB84 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4L3Q6VB84 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms