Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms