Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A10Q6U841 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms