Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCD3Q6STE5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms