Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP5Q6NZY7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms