Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3HQ6NTF7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms