Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT80Q6KB66 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms