Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 999 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCTP1Q6DN14 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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