Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEXMIFQ5QGS0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms