Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms