Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf46Q504U0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms