Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC38Q502W7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms