Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms