Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRY2Q49AN0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY2Q49AN0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms