Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q499Y3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q499Y3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q499Y3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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