Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP13-3Q3SY46 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms