Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Q1T7F1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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