Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms