Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LTC4SQ16873 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms