Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPROQ16827 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPROQ16827 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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