Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms