Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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