Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SGCAQ16586 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SGCAQ16586 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms