Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBBP7Q16576 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP7Q16576 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms