Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SNAPC1Q16533 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPC1Q16533 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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