Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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