Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ASIC2Q16515 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms