Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC6Q16204 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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