Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS72Q15906 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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