Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
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NCOA1Q15788 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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NCOA1Q15788 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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NCOA1Q15788 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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NCOA1Q15788 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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NCOA1Q15788 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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NCOA1Q15788 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NCOA1Q15788 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
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