Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms