Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDK1Q15118 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms