Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5R1Q15078 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5R1Q15078 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms