Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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