Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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